施設によっても異なりますが、人間ドックは基礎ドックと呼ばれる施設での必須の検査と、追加（オプション）で選ぶことができる専門検査オプションからなります。
基礎ドック
・身体測定
・血圧検査
・血液検査
・尿検査
・便検査
・心電図検査
・視力眼科検診
・聴力検査
・内科診察
・胸部X線検査
・肺機能
・上部消化管X線検査(胃透視)もしくは胃カメラ
・便潜血
・腹部超音波（エコー）
・腫瘍マーカー
・肝炎ウイルス
・子宮細胞診
※ただし、施設によってはこれらの基礎ドックの項目が、オプションとなることもあります。人間ドックに厳密な定義はなく、医療機関によって異なります。あくまで一例として参考にしてください。
専門検査オプション
・胸部CT 15,000円
・喀痰細胞診 1,500円
・腹部CT 15,000円
・内臓脂肪測定CT検査 15,000円
・BNP 3,000円
・負荷心電図 10,000円
・血圧脈波検査 3,000円
・心臓超音波（エコー） 10,000円
・冠動脈CT 40,000円
・頸動脈超音波（エコー）
・頭部MRI 30,000円
・骨盤MRI(前立腺/女性骨盤) 30,000円
・乳房X線（マンモグラフィー） 5,000円
・乳房超音波（エコー） 5,000円
・頸椎MRI 30,000円
・腰椎MRI 30,000円
・腫瘍マーカー 1つにつき3,000円。セットにしているところもあり。
・PET/PET-CT 100,000円
※検査の費用はあくまで目安です。施設により異なります。