身体計測
・身長
・体重
・肥満度
・ＢＭＩ
・腹囲
生理
・血圧測定：原則2回測定値と平均値
・心電図：負荷試験は任意で実施
・心拍数
・眼底検査：両眼撮り
・眼圧検査
・視力検査
・聴力検査
・呼吸機能検査：１秒率、％肺活量、％１秒量（対標準１秒量）
X線・超音波
・胸部X線：２方向（デジタル画像も可）
・上部消化管X線：食道・胃・十二指腸。４ツ切等８枚以上（デジタル画像も可）発泡剤、鎮痙剤、下剤の使用は任意とする。
※原則としてⅩ線検査とする。本人からＸ線検査が困難との申し出があり医師が必要と認めた場合、内視鏡検査に変更することも可。
・腹部超音波：検査対象臓器は胆のう・肝臓（脾臓を含む）・膵臓・腎臓とする。但し、膵臓検出できない時はその旨記載すること。
生化学
・総蛋白
・アルブミン
・クレアチニン
・尿酸
・総コレステロール
・HDLコレステロール
・LDLコレステロール：直接法とする（Friedewaldの計算式による算出でも可）
・中性脂肪
・総ビリルビン
・AST(GOT)
・ALT(GPT)
・γ-GTP
・ALP
・血糖(空腹時）
・血糖(75gブドウ糖負荷試験)：血糖3回(0,60,120分)明らかに糖尿病と判明している場合は省略し｢空腹時血糖」を実施する。
・HbA1c
血液学
・赤血球
・白血球
・血色素
・ヘマトクリット
・血小板数
・MCV
・MCH
・MCHC
血清学
・CRP
・血液型(ABO) ：本人の申し出により省略可
・血液型(Rh)：本人の申し出により省略可
・梅毒反応：本人の申し出により省略可（梅毒脂質抗原使用検査）
・HBs抗原：本人の申し出により省略可
尿
・蛋白
・PH
・尿糖
・沈渣：蛋白､潜血反応が陰性であれば省略可
・潜血
・比重
便
・便潜血：免疫法で実施(2回法)
問診･診察
・内科：胸部聴診、腹部触診等
情報提供
・特定健診情報提供を含む。
質問表
・特定健診質問票22項目を含む。
オプション検査項目
・乳房触診＋乳房画像診断
・婦人科診察＋子宮頸部細胞診（医師による）
・PSA検査
・HCV抗体
人間ドック学会より引用。赤字は一日ドック基本検査項目表と異なる所。